freebsd/ports
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6286b5f208cd4d4bd2f1663d46bd31bf0cefb0e4
ports/science
T
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Piotr Kubaj bffe69af05 science/cdo: fix build on powerpc64le, powerpc64 with CPUTYPE=power6 and newer with Clang 
Clang doesn't have __fsel function.
Taken from https://gcc.gnu.org/git/?p=gcc.git;a=blob;f=gcc/config/rs6000/ppu_intrinsics.h;h=e17faae05932e33c22697a3178b26314b88c9a31;hb=HEAD#l530
2021-02-16 16:42:28 +00:00
..
2d-rewriter
…
abinit
Update USES=python: math/py-pandas 1.2.0 requires Python 3.7+
2021-01-30 13:29:58 +00:00
afni
science/afni: update to 21.0.08
2021-02-12 22:36:58 +00:00
agrum
Update USES=python: math/py-pandas 1.2.0 requires Python 3.7+
2021-01-30 13:29:58 +00:00
aircraft-datcom
…
ALPSCore
…
antioch
…
apbs
…
atompaw
science/atompaw: Update 4.1.0.6 -> 4.1.1.0
2021-01-29 21:59:39 +00:00
avogadro2
…
avogadrolibs
…
axom
…
bagel
…
bddsolve
…
berkeleygw
…
bodr
…
buddy
…
cdcl
…
cdf
…
cdk
…
cdo
science/cdo: fix build on powerpc64le, powerpc64 with CPUTYPE=power6 and newer with Clang
2021-02-16 16:42:28 +00:00
cgnslib
…
cgribex
…
checkmol
…
chemical-mime-data
…
chemps2
science/chemps2: Update 1.8.9 -> 1.8.10
2021-02-01 09:53:54 +00:00
chemtool
…
chemtool-devel
…
chrono
science/chrono: Update 5.0.1 -> 6.0.0
2021-02-12 11:13:40 +00:00
clhep
…
clipper
…
code_saturne
…
colt
…
conduit
science/conduit: Update 0.6.0 -> 0.7.1
2021-02-12 20:49:39 +00:00
coordgenlibs
…
cp2k
…
cp2k-data
…
crf++
…
dalton
…
dcl
…
devisor
…
dftbplus
…
dkh
…
dlib-cpp
…
drawxtl
…
dvc
…
eccodes
Update to 2.20.0
2021-01-30 12:21:28 +00:00
elk
…
elmerfem
…
epte
…
erd
…
ergo
…
erkale
…
erkale-pseudopotentials
…
fastcap
…
fasthenry
…
fastjet
…
fisicalab
Update a few GNUstep ports:
2021-02-14 23:21:02 +00:00
fsom
…
fvcom
…
fvcom-mpi
…
gabedit
…
gamess-us
…
gchemutils
…
gdma
…
getdp
…
ghemical
…
ghmm
…
gnudatalanguage
…
gpaw-setups
…
gramps
…
grib_api
…
gromacs
…
gsmc
…
gtamsanalyzer
Update a few GNUstep ports:
2021-02-14 23:21:02 +00:00
h5utils
…
h5z-zfp
…
harminv
…
hdf
…
hdf5
…
hdf5-18
…
healpix
…
hepmc3
…
highfive
…
hypre
…
iboview
…
InsightToolkit
…
isaac-cfd
…
jdftx
…
jmol
science/jmol: Update 14.31.28 -> 14.31.29
2021-02-02 17:14:59 +00:00
jstrack
…
kalzium
Update KDE Release-Service to 20.12.2
2021-02-04 19:21:17 +00:00
kim-api
…
kst2
science/kst2:
2021-02-14 10:10:27 +00:00
lammps
…
lamprop
…
latte
…
libaec
Use upstream release tarball
2021-02-06 20:44:01 +00:00
libccp4
…
libcint
…
libctl
…
libefp
…
libgeodecomp
…
libghemical
…
libgridxc
…
libint
…
libint2
…
libkml
…
liblinear
…
libmsym
…
liboglappth
…
libquantum
…
libssm
…
libsvm
…
libsvm-python
…
libvdwxc
…
libxc
…
liggghts
…
luscus
…
madness
…
maeparser
…
massxpert
…
mbdyn
…
mcstas
…
mcstas-comps
…
mcxtrace
…
mcxtrace-comps
…
mdynamix
Do not include bsd.port.mk twice
2021-02-01 19:54:12 +00:00
medit
…
metaphysicl
…
minc2
…
mmdb2
…
mmtf-cpp
…
mol2ps
…
molgif
…
molscript
…
molsketch
…
mpb
…
mpqc
…
msms
…
multiwfn
…
namd
…
nest
…
netcdf
science/netcdf: move byteswap4 and byteswap8 fuctions higher so that they are declared when necessary
2021-02-15 16:31:32 +00:00
netcdf-cxx
…
netcdf-fortran
…
nifticlib
…
nwchem
…
nwchem-data
…
octopus
…
openbabel
…
openkim
…
openkim-models
science/openkim-model: Update 2019-07-25 -> 2021-01-28
2021-01-29 18:27:12 +00:00
opensim-core
…
opensph
…
opsin
…
p5-Algorithm-SVMLight
…
p5-Chemistry-3DBuilder
…
p5-Chemistry-Bond-Find
…
p5-Chemistry-Canonicalize
…
p5-Chemistry-Elements
…
p5-Chemistry-File-MDLMol
…
p5-Chemistry-File-Mopac
…
p5-Chemistry-File-PDB
…
p5-Chemistry-File-SLN
…
p5-Chemistry-File-SMARTS
…
p5-Chemistry-File-SMILES
…
p5-Chemistry-File-VRML
…
p5-Chemistry-File-XYZ
…
p5-Chemistry-FormulaPattern
…
p5-Chemistry-InternalCoords
…
p5-Chemistry-Isotope
…
p5-Chemistry-MacroMol
…
p5-Chemistry-MidasPattern
…
p5-Chemistry-Mok
…
p5-Chemistry-Mol
…
p5-Chemistry-Pattern
…
p5-Chemistry-Reaction
…
p5-Chemistry-Ring
…
p5-Geo-BUFR
…
p5-Geo-Coordinates-Converter
…
p5-Geo-Coordinates-Converter-iArea
…
p5-Geo-WebService-Elevation-USGS
…
p5-Mcstas-Tools
…
p5-PerlMol
…
p5-Physics-Unit
…
packmol
…
pagmo2
…
paje
Update a few GNUstep ports:
2021-02-14 23:21:02 +00:00
pcmsolver
…
PETSc
…
plumed
…
pnetcdf
…
pulseview
…
py-abipy
Update USES=python: math/py-pandas 1.2.0 requires Python 3.7+
2021-01-30 13:29:58 +00:00
py-access
Update USES=python: math/py-pandas 1.2.0 requires Python 3.7+
2021-01-30 13:29:58 +00:00
py-asdf
…
py-ase
science/py-ase: Update 3.21.0 -> 3.21.1
2021-01-29 16:38:20 +00:00
py-avogadrolibs
…
py-cdo
…
py-chainer
…
py-chainer-chemistry
Update USES=python: math/py-pandas 1.2.0 requires Python 3.7+
2021-01-30 13:29:58 +00:00
py-chempy
…
py-coards
…
py-DendroPy
…
py-dipy
…
py-dlib
…
py-eccodes
Convert to test framework
2021-02-06 20:47:09 +00:00
py-esda
Update USES=python: math/py-pandas 1.2.0 requires Python 3.7+
2021-01-30 13:29:58 +00:00
py-geolinks
…
py-geomet
Update to 0.3.0
2021-01-30 12:25:36 +00:00
py-geometer
…
py-geometric
…
py-gpaw
science/py-gpaw: Update 20.10.0 -> 21.1.0
2021-02-15 05:08:17 +00:00
py-GPy
…
py-GPyOpt
…
py-gsd
…
py-h5json
…
py-h5py
…
py-inequality
…
py-jupyter_jsmol
Upgrade to v0.2.6.
2021-01-29 18:37:56 +00:00
py-kim-query
…
py-kinematics
…
py-kliff
science/py-kliff: Update 0.1.7 -> 0.2.0
2021-02-16 00:31:47 +00:00
py-liac-arff
…
py-libpysal
Update to 4.4.0
2021-02-03 19:49:19 +00:00
py-lifelines
Update USES=python: math/py-pandas 1.2.0 requires Python 3.7+
2021-01-30 13:29:58 +00:00
py-MDAnalysis
…
py-MDAnalysisTests
Update USES=python: math/py-pandas 1.2.0 requires Python 3.7+
2021-01-30 13:29:58 +00:00
py-mdp
…
py-mmtf-python
…
py-molmod
…
py-moltemplate
science/py-moltemplate: Update 2.19.4 -> 2.19.5
2021-02-07 23:14:39 +00:00
py-netCDF4
…
py-netcdf-flattener
…
py-nibabel
…
py-nilearn
Update USES=python: math/py-pandas 1.2.0 requires Python 3.7+
2021-01-30 13:37:02 +00:00
py-obspy
…
py-oddt
Update USES=python: math/py-pandas 1.2.0 requires Python 3.7+
2021-01-30 13:29:58 +00:00
py-OpenFermion
…
py-openpiv
…
py-paida
…
py-paramz
…
py-phono3py
…
py-phonopy
science/py-phonopy: Update 2.9.0 -> 2.9.1
2021-01-30 10:43:11 +00:00
py-pupynere
…
py-pyaixi
…
py-pycsw
…
py-pydicom
…
py-PyFR
…
py-pygeodesy
Update to 21.1.21
2021-01-30 12:25:47 +00:00
py-pygeometa
…
py-pygmo2
…
py-pymatgen
science/py-pymatgen: Update 2019.10.16 -> 2021.2.14
2021-02-16 01:29:30 +00:00
py-pymol
…
py-pyosf
…
py-pysal
Update to 2.3.0
2021-02-01 19:35:52 +00:00
py-pyteomics
…
py-qcelemental
…
py-qcengine
…
py-qspin
…
py-quantities
…
py-rmf
…
py-rmsd
…
py-ruffus
…
py-scikit-fuzzy
…
py-scikit-learn
…
py-scikit-optimize
…
py-scikit-sparse
…
py-scimath
…
py-scipy
…
py-scoria
…
py-segregation
Update USES=python: math/py-pandas 1.2.0 requires Python 3.7+
2021-01-30 13:29:58 +00:00
py-segyio
…
py-SimpleSpectral
…
py-spaghetti
Update to 1.5.6
2021-02-03 19:49:25 +00:00
py-spglib
science/py-spglib: Update 1.16.0 -> 1.16.1
2021-02-01 04:28:32 +00:00
py-tensorflow
Bump PORTREVISION for devel/re2 shlib change
2021-02-03 19:46:35 +00:00
py-tobler
Update to 0.7.0
2021-02-03 19:49:32 +00:00
py-veusz
…
pybrain
…
pynn
…
qbox
…
qcl
…
qiskit-aer
…
qmcpack
…
quantum-espresso
…
quantum-espresso-pseudopotentials
…
qwalk
…
R-cran-AMORE
…
R-cran-bayesm
…
R-cran-cmprsk
…
R-cran-DCluster
…
R-cran-e1071
…
R-cran-eco
…
R-cran-Epi
- Update to 2.43
2021-01-30 04:53:09 +00:00
R-cran-epicalc
…
R-cran-etm
…
R-cran-FAdist
…
R-cran-fastICA
…
R-cran-kernlab
…
R-cran-snow
…
R-cran-som
…
R-cran-udunits2
…
rdkit
…
rmf
…
rubygem-ai4r
…
rubygem-cdo
…
rubygem-rgeo
…
rubygem-rgeo-geojson
…
rubygem-rgeo-proj4
…
rubygem-rgeo-shapefile
…
rubygem-ruby-dcl
…
rubygem-ruby-netcdf
…
scidavis
…
segyio
…
shelxle
science/shelxle: Update 1.0.1215 -> 1.0.1226
2021-02-12 20:38:28 +00:00
siesta
…
sigrok-cli
…
sigrok-firmware
…
sigrok-firmware-fx2lafw
…
sigrok-firmware-utils
…
silo
…
simbody
…
simgrid
…
simint
…
simlib
…
simsmith
…
smoldyn
…
sparta
…
spglib
science/spglib: Update 1.16.0 -> 1.16.1
2021-02-14 04:51:30 +00:00
step
Update KDE Release-Service to 20.12.2
2021-02-04 19:21:17 +00:00
svmlight
…
szip
…
teem
…
tfel
…
tfel-edf
…
thermofun
New port: science/thermofun: Code for calculating thermodynamic properties of materials
2021-02-02 00:48:20 +00:00
tinker
…
udunits
…
v_sim
…
vipster
…
vmd
…
voro++
…
votca
…
wannier90
…
wwplot
…
wxmacmolplt
…
xcrysden
…
xdrawchem
…
xtb
…
yoda
…
Makefile
Sort SUBDIRs
2021-02-06 20:42:39 +00:00